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小分子抑制剂可以与蛋白质的活性位点或变构位点结合从而废除其功能这是一种占据目标蛋白质上的特定位点驱动蛋白质功能丧失的作用方式。小分子抑制剂面临两大挑战耐药突变和难以用药的靶点。一方面对小分子抑制剂有反应的患者最终会产生耐药性这主要是由于耐药突变。另一方面占据驱动的作用模式需要目标蛋白上有明确的口袋凹槽这些口袋凹槽可以被小分子占据。
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